Das Nest des Hammerkopfs hat einen Durchmesser von bis zu eineinhalb Metern. Beide Partner helfen beim Bau. Zuerst werden Zweige aufeinandergeschichtet, die mit Schlamm verklebt werden. So entsteht einen Plattform. Dann werden die Wände gebaut und zuletzt ein kuppelartiges Dach. Der Zugang zum Nest erfolgt von der Unterseite und mündet in einen halben Meter langen Tunnel bis zur Nistkammer. Ein Paar baut häufig mehrere Nester. Das beliebteste Nest wird während mehreren Jahren benutzt und dabei immer wieder ausgebessert und ausgebaut.